Det mandlige kønsorgan består af både ydre og indre dele. De ydre mandlige kønsorganer inkluderer penis, urinrør og pungen. De indre mandlige kønsorganer inkluderer sædblæren, testikler, vas deferens, epididymis, prostata, bulbourethral kirtel og ejakulatorisk kanal.
Penis er hoveddelen af eksterne mandlige kønsorganer, som har både seksuelle og kropsfunktioner. Det er i stand til at ejakulere sæd (indeholdende sæd) under sex og for at lindre kroppen af urin. Urinrøret transporterer urinen fra blæren ud af den mandlige krop. Sæd rejser også gennem urinrøret.
Hver mand har to pungposer, som huser visse dele af de indre mandlige kønsorganer (epididymis, testikler og nedre sædkabler). Testiklerne er den vigtigste del af indre mandlige kønsorganer, fordi de fremstiller og opbevarer sæd, samt forsyner den mandlige krop med hormoner, der styrer udviklingen af mandlige egenskaber og reproduktive organer.
Epididymis lagrer, modnes og transporterer sæd mellem testiklerne og vas deferens, som kanaliserer sæd mod urinrøret. Sædblærerne støder op til urinrøret og udskiller en mælkeagtig væske, der i sidste ende udledes gennem ejakulationskanalen. Bulbourethral kirtler hjælper også med udledning af sæd.