Den indre pudendale arterie forgrener sig fra den indre iliaca arterie og afgiver iltet blod til de ydre kønsorganer hos både mænd og kvinder. På grund af køn er der dog nogle anatomiske forskelle.
Arterien har tendens til at være mindre hos kvinder. Også nogle af arterierne i arterien er specifikke for køn. Hos mænd inkluderer grene af denne arterie dorsal og dyb arterie af penis, mens kvinder har en dorsal og dyb arterie af klitoris. Kvinder har posterior labiale grene, mens mænd har scrotal grene. Der er også andre kar fra denne arterie, der er specifik for kønsorganerne.
De ringere rektale og perineale arterier, der forgrener sig af den indre pudendale arterie, er de samme i begge køn.
